Em formação

Como buscar dados genéticos disponíveis relevantes para a ecologia e a evolução?

Como buscar dados genéticos disponíveis relevantes para a ecologia e a evolução?


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Eu dei uma olhada rápida online. Parece que existem muitos sites diferentes de arquivamento de banco de dados. Alguns dados podem ser gratuitos, enquanto outros podem não ser. Encontrei coisas como Dryad, TreeBase, DataOne ou GeneBank. Eu acho que várias revistas (American Naturalist, Molecular Ecology, Science e Nature para exemplos) forçam seus autores a disponibilizarem seus dados

Questão Geral

Você pode fazer uma breve revisão de quais bancos de dados existem, quais são suas propriedades (que tipo de dados, quais licenças e taxas) e como buscar dados (são conjuntos de dados associados a palavras-chave ou temos que procurar um papel e então procure seus dados).

Estudo de caso

Imagine, por exemplo, que você está procurando dados SNP de uma população espacialmente explícita que recentemente passou por uma expansão de alcance (pode ser muito preciso, você pode querer abandonar algumas especificações). Como você procuraria esse tipo de dados? (Não há necessidade de retirar dados, mas apenas para descrever um procedimento).


Como bioinformático, uma de minhas tarefas é frequentemente obter informações de bancos de dados ou encontrar o banco de dados correto para comparar. Existem vários bancos de dados grandes, mas mesmo esses são muitos para qualquer pessoa saber. Existem bancos de dados especializados em dados genéticos, alguns especializados em informações taxonômicas, alguns em informações ecológicas e, em seguida, existem bancos de dados específicos de espécies que coletam todos os tipos de dados de uma determinada espécie, gênero ou clado.

Para mim, a maior fonte de informações generalizadas seriam os bancos de dados NCBI, incluindo GenBank para a sequência de nucleotídeos, seu banco de dados de proteínas e talvez dbSNP para, bem, SNPs. Depois, há vários bancos de dados 16S que usei, há UCSC para os dados básicos sobre o genoma humano, flyBase for Drosophila, ... Acho que o ponto deve ser claro. E esses são apenas os que acabaram de vir à minha mente.

Se você não tiver uma pergunta muito exata para responder, como "Existe um gene semelhante ao gene x da Drosophila presente em alguma bactéria?" pode ser muito difícil escolher o banco de dados correto e também encontrar as informações importantes nele de forma eficiente.

Depois, há o problema dos metadados. Posso encontrar dados de sequenciamento do microbioma intestinal de um ser humano tratado com antibióticos com bastante facilidade. Se estou procurando um antibiótico específico administrado por um período mínimo de sete dias a um ser humano saudável diferente, de preferência incluindo pelo menos uma criança amamentada e sua mãe (que estava tomando os antibióticos, não a criança), então está ficando complicado . Aqui é geralmente muito mais fácil escanear o PubMed para algumas publicações relevantes sobre o assunto e descobrir se eles usaram conjuntos de dados publicados ou publicaram seus próprios.


A Evolução da Ecologia

A disciplina científica da ecologia é dinâmica, impregnada de tradição histórica, mas adaptando-se ao ambiente em mudança e construindo sua própria rede ecológica de interações com outras disciplinas. O que é ecologia, quais foram alguns de seus pontos altos e, o mais importante, para onde ela está indo? Todos nós no planeta Terra hoje, não apenas os cientistas, precisamos saber as respostas. A sociedade está cada vez mais consciente de que estamos perdendo partes cruciais de nosso ecossistema, e que as atividades dos seres humanos estão ameaçando a sustentabilidade da biosfera como um sistema de suporte de vida para a humanidade. Como escrevi em outro lugar, "Ecologia, a ciência unificadora na integração do conhecimento da vida em nosso planeta, tornou-se a ciência essencial para aprender como preservá-la."

A palavra "ecologia" não existia quando Charles Darwin publicou seu jornal, A Viagem do Beagle, mas pode-se argumentar que o relato de Darwin lançou a ecologia como uma disciplina. Darwin começou lembrando a seus leitores que ele já havia publicado volumes sobre recifes de coral, ilhas vulcânicas e a geologia da América do Sul. Sua integração das dimensões físicas e biológicas dos lugares onde o Beagle parado, complementado por influente trabalho contemporâneo do naturalista inglês Alfred Russel Wallace, definiu uma maneira nova e sintética de olhar a natureza - na qual os padrões característicos de regiões particulares encontraram explicação em uma estrutura unificadora e dinâmica. O termo “oekologie” veio depois, a inspiração do cientista e médico alemão Ernst Haeckel, mas foram as teorias de Darwin e Wallace que criaram o rico entendimento que permitiu que a nova abordagem rapidamente se tornasse uma ciência.

Assim, a ecologia surgiu de um casamento entre geologia e história natural, enraizada na observação, mas respondendo à necessidade de uma estrutura conceitual. Desde suas raízes iniciais, tornou-se cada vez mais rigoroso e quantitativo e, um século depois, forneceu a disciplina natural para responder aos desafios ambientais destacados por Rachel Carson, Paul Ehrlich e outros. Os estudos ecológicos e ambientais constituíram uma parceria natural, uma vez que o estudo científico da ecologia forneceu as ferramentas para enfrentar muitas das ameaças ambientais emergentes, enquanto essas ameaças, por sua vez, forneceram novos estímulos para investigações ecológicas.

Áreas como a ecotoxicologia, que estuda o destino, o transporte e os efeitos dos produtos químicos no meio ambiente, e a biologia da conservação, que busca preservar a biodiversidade, foram geradas, intimamente ligadas à ecologia, mas muito mais aplicadas em foco. A sinergia entre as disciplinas era construtiva, mas também tendia a confundir as distinções aos olhos do público entre a ciência da ecologia e a aplicação dos princípios ecológicos à gestão dos recursos naturais. Ecologia é uma disciplina científica, como a física ou biologia molecular, cujos praticantes são movidos pela busca de padrões e processos na natureza. Suas descobertas podem informar as decisões políticas sobre o uso de recursos, poluição, mudança climática e outras questões ambientais, mas a defesa das decisões sobre nossas prioridades ambientais está fora da disciplina da ecologia. Ainda assim, para muitas pessoas, “ecologista” tornou-se um termo aplicado a qualquer pessoa que quisesse salvar o planeta, ou selecionar partes dele, o que não fazia mais sentido do que chamar de astrônomo alguém que se maravilha com o céu noturno.

A aplicação de princípios ecológicos aos problemas ambientais não ocorreu repentinamente com a publicação de Primavera Silenciosa em 1962 que, como a ecologia como um todo, tinha raízes muito mais antigas. A indústria pesqueira forneceu um primeiro estudo de caso há quase um século, quando o ilustre biólogo italiano Umberto D’Ancona ficou intrigado com as causas das flutuações nas pescarias do Adriático. Felizmente, D’Ancona iria se casar com a filha do grande matemático italiano, Vito Volterra, que se interessou por aplicar suas habilidades em matemática formal ao estudo dos sistemas biológicos e sociais. Volterra é famoso entre os matemáticos por suas contribuições à teoria dos funcionais e equações integrais, mas é ainda melhor e mais amplamente conhecido pelas equações que ele e Alfred Lotka derivaram independentemente para descrever a dinâmica das espécies em interação. Volterra mostrou que o mais simples dos ecossistemas, envolvendo apenas uma espécie de predador e sua presa, poderia passar por ciclos intermináveis ​​de mudança no número de indivíduos à medida que o crescimento da população de presas produzia um aumento semelhante no predador que, por sua vez, levava a um declínio no presa, seguido por um declínio no predador, trazendo o círculo completo de ambas as populações.

No entanto, a maior contribuição de Volterra não foi em suas equações específicas, mas sim na ideia heterodoxa de que métodos matemáticos sofisticados podem ser usados ​​para entender a dinâmica dos sistemas naturais. As equações de Volterra e Lotka são ensinadas hoje em praticamente todos os primeiros cursos de ecologia, e a aplicação de métodos matemáticos e computacionais se expandiu para todos os ramos da ecologia, dando-nos, por exemplo, modelos integrados que lidam com a interação entre um clima em mudança e o crescimento de florestas e outras vegetações. A influência da matemática e da computação na biologia como um todo também se expandiu na última década, e campos como biologia de sistemas (o estudo da interação entre as partes de sistemas biológicos, como sistemas moleculares ou metabólicos) e biologia computacional (com seu uso matemática e computação) tornaram-se partes essenciais de qualquer departamento de biologia moderno. Não deve ser perdido, no entanto, que por meio da

Tribuções de Volterra e daqueles que seguiram seus passos, a ecologia foi a primeira subdisciplina da biologia a se tornar profundamente quantitativa.

Isso é importante, porque a pesca e as florestas são talvez os casos mais importantes de populações naturais exploradas pelos seres humanos para obter alimentos, fibras e combustível - são exemplos do que hoje são chamados de “bens e serviços do ecossistema”. Gerenciar a pesca apresenta desafios únicos em comparação com a agricultura, ou mesmo com as florestas, porque muitos dos recursos do oceano estão além do controle do gerente. A importância econômica da pesca, e a importância de manejá-la para otimizar os benefícios que dela derivam para o ser humano, tem gerado uma rica literatura teórica e aplicada, com alguns sucessos e muitos fracassos. A pesca marinha sempre forneceu um sustento crucial para os seres humanos, mas muitas das unidades populacionais mais favorecidas entraram em colapso devido à sobrepesca. Isso levou ao reconhecimento de que precisamos prestar mais atenção aos insights de D’Ancona e Volterra e gerenciar a pesca como componentes de ecossistemas complexos, em vez de entidades independentes. Mesmo hoje, a maioria dos esforços de gestão concentra-se em determinadas espécies, como o salmão, por muitas das mesmas razões pelas quais a Lei de Espécies Ameaçadas se refere a espécies e populações individuais, tal especificidade pode refletir os constituintes que salmão ou truta, ou pandas ou tigres, desfrutam— e, de maneira mais geral, simplifica o gerenciamento. Há um reconhecimento crescente, entretanto, de que qualquer espécie faz parte de uma rede maior de espécies, competindo por recursos comuns, e que tais interconexões não podem ser ignoradas mais do que os formuladores de política econômica nos Estados Unidos podem ignorar os problemas da Islândia ou da Grécia.

A pesca forneceu apenas um exemplo inicial e importante da aplicação de perspectivas matemáticas e ecológicas ao bem-estar humano. Dois outros exemplos vêm da epidemiologia e da demografia. As doenças infecciosas envolvem uma interação ecológica fundamental, aquela entre um parasita e seu hospedeiro. Os sistemas parasita-hospedeiro são semelhantes em muitos aspectos aos sistemas predador-presa e, portanto, exibem o mesmo potencial de oscilação que Volterra demonstrou. Essa dinâmica oscilatória é muito familiar para nós, por exemplo, nas flutuações sazonais dos casos de gripe. Há uma diferença, entretanto, em que os parasitas vivem dentro dos hospedeiros e, portanto, podem morrer quando seus hospedeiros morrem, a menos que possam ser transmitidos a outros hospedeiros. De uma perspectiva evolutiva, isso sugere que os sistemas parasita-hospedeiro irão evoluir para favorecer parasitas menos virulentos, porque as cepas mais virulentas matam seus hospedeiros antes que possam se espalhar para outros hospedeiros - há evidências consideráveis ​​para apoiar esse conceito. Um exemplo notável envolve a documentação do virologista Frank J. Fenner, começando nas décadas de 1940 e 50, da evolução da virulência reduzida do vírus mixoma na Austrália, quando foi introduzido para controlar novamente o coelho europeu. Uma perspectiva ecológica se mostrou crucial para o manejo bem-sucedido da praga dos coelhos.

A demografia forneceu talvez o exemplo mais antigo da aplicação do pensamento ecológico e matemático aos problemas das populações naturais. Demógrafos como John Graunt, já no século 17, usavam métodos matemáticos sofisticados para projetar o crescimento da população humana, com base em métodos que eram conhecidos há séculos, remontando ao matemático conhecido como Fibonacci. Graunt também reconheceu que as taxas de crescimento observadas para a população de Londres não eram sustentáveis ​​e não poderiam ter existido historicamente, ou então a população de Londres teria sido muito maior do que era. No início do século 18, Thomas Malthus, em Um ensaio sobre o princípio da população, Enfatizou que fatores essencialmente ecológicos, como fome e doenças, acabam por restringir o crescimento da população; essa percepção foi incorporada a uma série de modificações matemáticas das equações básicas de crescimento exponencial. A ciência da demografia desenvolveu uma base matemática elegante desde então, e sua dimensão evolutiva - a teoria da história da vida, que busca elucidar o impacto da seleção natural no ciclo de vida, é a pedra angular da teoria ecológica.

É claro que, devido às implicações para o crescimento econômico, essas questões sempre permanecerão controversas. Em 1968, Ehrlich's A Bomba Populacional alertou sobre as possibilidades devastadoras, como a fome em massa, de crescimento populacional ilimitado. Isso levou a um debate animado e freqüentemente rancoroso sobre a inevitabilidade da limitação populacional e o potencial da tecnologia para atender às necessidades de uma população mundial que cresce sem limites. Para um ecologista, parece evidente que os recursos da terra são, em última análise, finitos e que as populações não podem crescer sem limites. Onde estão esses limites e o tamanho da população que o mundo pode sustentar é a essência do debate.

E onde estamos agora? Os escritos de Darwin e Wallace claramente influenciaram o desenvolvimento da ecologia, mas talvez ainda mais fundamentalmente, eles também lançaram o campo da evolução. A seleção natural é apenas um dos muitos fatores que influenciam a mudança evolutiva, mas é o mais importante por fornecer um elo com o contexto ecológico no qual os organismos existem e interagem. Quando Darwin desenvolveu suas teorias, nossa compreensão dos mecanismos genéticos subjacentes à evolução estava em sua infância. No início do século 20, a teoria da genética populacional desenvolveu-se rapidamente, em estreita parceria com a criação de animais e plantas, e com uma base matemática sólida. Então, em meados do século 20, ocorreu a unificação entre a genética populacional e a teoria da evolução. A Síntese Moderna forneceu uma estrutura para uma unificação semelhante com os estudos ecológicos, mas essa etapa teve que esperar enquanto a genética se voltava para o desenvolvimento de uma compreensão mais profunda dos detalhes moleculares do controle genético de aspectos básicos, como desenvolvimento e fisiologia. À medida que essa base se solidificou, uma atenção cada vez maior passou a ser direcionada para a biologia de sistemas - como o conjunto complexo de circuitos genéticos coopera para produzir e operar o organismo, como o organismo interage com outros organismos e seu ambiente, e como comunidades e ecossistemas inteiros emergem de processos evolutivos no nível microscópico. A coleção de vastas quantidades de informações “metagenômicas”, envolvendo material genético de muitas espécies nos mesmos ambientes, tem grande potencial para nos permitir estender os estudos evolutivos para além das espécies individuais, para os ecossistemas complexos em que vivem peixes, pandas e tigres.

Talvez o cientista que mais influenciou o desenvolvimento da ecologia no século passado foi o limnologista G. Evelyn Hutchinson, que estudou águas interiores, mas escreveu incisivamente sobre quase todos os aspectos da ecologia, fornecendo um contexto evolutivo para a compreensão das características ecológicas e dos padrões do ecossistema. No entanto, embora a unificação dos vários níveis de organização possa ter ficado clara na mente de Hutchinson, três ou quatro décadas atrás os assuntos de biologia populacional e ciência de ecossistemas eram mundos separados intelectualmente, e os líderes de ambos lutavam para encontrar maneiras de se comunicarem entre si . Esse abismo diminuiu drasticamente, à medida que os biólogos populacionais começaram a enfatizar a importância da coevolução - como as populações em evolução influenciam umas às outras - e a construção de nichos - como os organismos moldam seus próprios papéis ecológicos e os de outros organismos. Os cientistas do ecossistema agora se esforçam para entender os padrões de uso e ciclagem de nutrientes dentro de uma estrutura evolutiva, os epidemiologistas se concentram na coevolução de hospedeiros e parasitas e buscam compreender a história evolutiva de vírus e bactérias, e avanços rápidos em genômica e metagenômica criam desafios para a compreensão sua relevância para a distribuição e abundância de organismos em seus ambientes naturais.

A disciplina científica da ecologia tem sido, em certo sentido, um nó-chave em uma ecologia de disciplinas científicas. Desde suas raízes na história natural, construiu parcerias com botânica e zoologia com geologia e paleontologia com matemática e com estudos evolutivos, desde biologia molecular até genética populacional e desenvolvimento. Não ignorou a física e a engenharia ao longo do caminho, em sua necessidade de compreender a mecânica de como os animais e plantas crescem e se movem, ou como capturam energia e resistem ao estresse - por que, por exemplo, as árvores têm o formato que têm. Ecologistas ganham a vida reconhecendo a interconexão de diferentes partes e diferentes disciplinas.

Mas o que está faltando na história até este ponto são fortes vínculos com as ciências sociais e políticas, e com as humanidades. Essas dimensões não estiveram totalmente ausentes no passado. Alguns ecologistas da conservação reconheceram a importância de deixar claro que a diversidade biológica deve ser preservada não apenas para seu próprio bem, mas porque ela está subjacente a uma ampla gama de bens e serviços que são essenciais para toda a vida em nosso planeta, incluindo alimentos, fibras, combustível e produtos farmacêuticos. Também recebemos benefícios indiretos da polinização, de plantas que moderam as mudanças climáticas absorvendo dióxido de carbono e de habitats que sequestram nutrientes e toxinas - todos esses são tópicos ativos de investigação ecológica hoje.

O que devemos fazer agora, no entanto, é unificar ainda mais a ciência e as ciências sociais e humanas a serviço da preservação da terra. Esse desafio está levando a ecologia a novas direções. Para sustentar o planeta, devemos ser capazes de proteger os bens e serviços que os ecossistemas fornecem, e isso exige saber o que eles significam para nós. Em grande parte, esse é o domínio da economia. Trazer ecologia e economia não é novo, e a maioria das universidades que concedem terras têm departamentos de economia agrícola e de recursos que lidam com a economia da agricultura, pesca e florestas. Mas novas dimensões na economia ambiental e ecológica têm se desenvolvido rapidamente, com foco em questões sobre o valor de ecossistemas inteiros, sobre o projeto ideal de reservas naturais e sobre como gerenciar bens públicos.Amplamente compreendidos, os bens públicos ambientais incluem o ar que respiramos e a água que bebemos, os peixes que pescamos e os lagos e oceanos que os sustentam, bem como os antibióticos que tanto contribuíram para o avanço da assistência médica.

Ainda assim, a cooperação para o bem comum é vulnerável a trapaceiros que podem obter benefícios sem pagar sua parte justa, e não pode ser sustentada sem novos mecanismos e instituições. Nossos líderes políticos já começaram a reconhecer que, ao lidar com os sistemas financeiros interconectados do mundo, isso se aplica com pelo menos igual força ao nosso meio ambiente. Soluções para os grandes desafios ambientais que enfrentamos exigirão parcerias profundas entre ecologistas, economistas e outros cientistas sociais.

Os cientistas também precisarão trabalhar com humanistas e especialistas em ética, à medida que lidamos com os problemas centrais da equidade intergeracional e intrageracional, e o poderoso papel das normas sociais na formação de comportamentos individuais. Quanto de nossos recursos é justo consumir hoje e quanto devemos deixar para as gerações futuras? Como lidamos com a crescente desigualdade na distribuição da riqueza entre nossas populações hoje e as implicações para o acesso aos recursos naturais?

Tal como acontece com as parcerias que a ecologia formou no passado, os benefícios provavelmente serão mútuos, meses antes da atual crise financeira, meus co-autores e eu sugerimos em um artigo em Natureza que uma perspectiva ecológica seria útil para lidar com questões de risco sistêmico no sistema bancário porque, argumentamos, o sistema estava muito interconectado e vulnerável à propagação contagiosa de distúrbios devido, por exemplo, à confusão das hipotecas subprime. O sistema bancário, assim como a economia, é uma espécie de sistema ecológico e deve ser administrado como um só.

A ecologia vê os sistemas biológicos como todos, não como partes independentes, enquanto procura elucidar como os todos emergem e afetam as partes. Cada vez mais, essa perspectiva holística, rebatizada em lugares como o Instituto Santa Fé como "a teoria dos sistemas adaptativos complexos", tem informado a compreensão e melhorado o gerenciamento dos sistemas econômicos e financeiros, sistemas sociais, materiais complexos e até mesmo fisiologia e medicina. Essencialmente, isso significa pouco mais do que adotar uma abordagem ecológica para tais sistemas.


Biologia (BIOL)

Cada um dos seguintes cursos tem um componente de laboratório de 3 horas por semana, salvo indicação em contrário. Os alunos devem ser aprovados nos componentes laboratoriais e teóricos de um curso para serem aprovados no curso. Uma nota mínima C é exigida em todos os cursos de biologia aplicados ao Programa de Biologia do aluno.

Uma nota mínima de C é exigida para todos os pré-requisitos de BIOL para cursos de BIOL de nível 2.000, 3.000 e 4.000.

Este curso é uma introdução aos princípios da vida nos níveis celular e molecular. Os principais tópicos incluem as moléculas que codificam informações biológicas, células procarióticas e eucarióticas, membranas e compartimentos celulares, respiração celular, fotossíntese, transcrição e tradução, replicação de DNA e divisão celular, mutação, variação e herança.

Este curso é uma introdução ao estudo dos princípios e da organização da vida, incluindo anatomia, forma e função, fisiologia, história de vida e ecologia. Os tópicos incluem as origens da vida eucariótica e multicelular, estrutura e função das plantas, crescimento e reprodução das plantas, diversidade de plantas e animais, temas de fisiologia animal, evolução e ecologia populacional.

Os alunos examinam a base biológica do uso humano de cannabis. Os tópicos incluem a ecologia e evolução da cannabis como planta selvagem, domesticação e horticultura, psicoatividade, neurologia, efeitos terapêuticos e adversos na saúde humana.

Este curso é um levantamento da anatomia humana básica. Os alunos são apresentados às estruturas anatômicas fundamentais e à terminologia usada por anatomistas. Os alunos investigam as principais estruturas dos onze sistemas de órgãos, bem como a organização dos tecidos, tecidos conjuntivos e articulações.

Este curso é uma introdução à biologia vegetal, com ênfase na estrutura, reprodução e desenvolvimento das angiospermas, mecanismos básicos de fotossíntese e respiração, nutrição das plantas e regulação do crescimento. As plantas terrestres também são estudadas a partir de uma perspectiva evolutiva, abrangendo desde a primeira aparição das plantas na terra até os principais grupos presentes hoje.

Os alunos são apresentados ao tratamento taxonômico dos principais filos animais com referência à anatomia, função e significado ecológico.

Este curso é uma introdução aos principais tópicos da genética. A ênfase é colocada em como os genes são passados ​​de geração em geração e como os genes interagem uns com os outros. Os tópicos incluem o ambiente que determina o fenótipo, a criação da variação genética, o mapeamento de genes nos cromossomos e a aplicação prática desse conhecimento.

Este curso é uma introdução à célula eucariótica com ênfase na base química e genética das atividades celulares e na divisão da célula em compartimentos ligados à membrana e bioquimicamente especializados. São considerados a membrana plasmática, citosol, núcleo, citoesqueleto, aparelho de Golgi, mitocôndria, cloroplastos e retículo endoplasmático.

Ecologia é o estudo das interações e relações entre os organismos e seu ambiente, como adaptações, competição e predação. Os tópicos incluem a densidade, diversidade e distribuição de organismos, dinâmica populacional, relações e estrutura da comunidade, sucessão e o fluxo de energia e matéria através dos ecossistemas.

Este curso é uma introdução ao fascinante mundo dos insetos. A anatomia, fisiologia e taxonomia deste grupo são examinadas. O exame de espécimes de insetos e o reconhecimento das principais características de identificação são o foco.

Os alunos examinam as definições e princípios básicos da fisiologia nos níveis molecular, celular e de tecido. Os tópicos incluem os fundamentos da estrutura e função da membrana, enzimas e cinética enzimática, bioenergética, transdução de sinal, regulação de feedback, estrutura celular, função e integração de neurônios e músculos esqueléticos.

Os alunos estudam todos os aspectos dos protocolos e interpretação de tipagem de DNA forense. As palestras enfocam a teoria e as sessões de laboratório envolvem a tipagem real do DNA, onde os alunos trabalham com seu próprio DNA. Essas habilidades são altamente transferíveis e são aplicáveis ​​à análise genética de populações em geral.

Os alunos examinam vertebrados, levando em consideração as modificações estruturais para estilos de vida específicos. Uma abordagem comparativa e evolutiva é feita em palestras. A instrução de laboratório envolve a dissecção de animais representativos.

Os alunos estudam a fisiologia dos vertebrados e as adaptações fisiológicas. Os tópicos incluem a integração dos onze sistemas de órgãos e como eles interagem para manter a homeostase. A fisiologia dos vertebrados é comparada no que diz respeito ao seu ambiente específico ou ao sucesso do indivíduo.

Os alunos são apresentados aos métodos de representação gráfica e análise de dados quantitativos nas ciências biológicas, com ênfase nas aplicações práticas da estatística em biologia. Os tópicos incluem estatísticas descritivas, distribuições normais e não normais, probabilidade, correlação, regressão, testes de significância, como análise de variância e métodos de amostragem.

Este é um curso prático sobre a identificação de plantas em tipos de vegetação importantes na Nova Escócia. Os alunos examinam os princípios da taxonomia das plantas, preparam espécimes de plantas e diferenciam os tipos de habitat. Os tópicos incluem a ecologia das adaptações das plantas ao ambiente local, ecologia aplicada e biologia da conservação dos principais tipos de habitat.

A sistemática contemporânea inclui o estudo da diversidade de espécies e suas relações ao longo do tempo. Os alunos examinam os caracteres das espécies e análises de caracteres, códigos internacionais de nomenclatura, protocolos para descrever novas espécies, análises filogenéticas baseadas em cladística e sequências moleculares, classificação biológica e a importância de avaliar as relações evolutivas entre os táxons.

Os alunos são apresentados à ecologia do ecossistema examinando os padrões e processos do ecossistema. Os tópicos incluem hierarquia biológica, fluxo de energia e material através dos sistemas, estrutura do ecossistema e análise da rede alimentar, montagem / sucessão do ecossistema, estabilidade e resiliência e reversão sucessional e respostas do ecossistema ao estresse. São examinados “Saúde do Ecossistema”, “Nova Ecologia” e a “Avaliação do Milênio das Nações Unidas” baseada no ecossistema.

Este curso é uma introdução ao mundo dos microrganismos, os meios pelos quais são estudados e seu papel nas doenças humanas. Os tópicos podem incluir: a origem e descoberta da vida microbiana, estrutura e função das células procarióticas, crescimento e desenvolvimento celular e o papel das bactérias, fungos, vírus e protozoários no que diz respeito ao desenvolvimento de doenças humanas.

A genética populacional é a integração da matemática com a biologia populacional, genética e evolução e permite aos pesquisadores inferir quantitativamente o que está acontecendo dentro e entre as populações com base em dados genéticos. Os alunos se concentram no desenvolvimento de uma compreensão básica dos princípios fundamentais da genética populacional e sua aplicação a problemas do mundo real.

Os alunos são apresentados à química dos genes, DNA, RNA e estrutura de proteínas. Os tópicos incluem transcrição, tradução, replicação de DNA e RNA e a organização de genes e genomas. Os alunos também aprenderão técnicas moleculares básicas.

Este curso é uma introdução ao estudo das plantas usadas pelas pessoas, sua origem, domesticação, botânica, cultivo, colheita, usos, doenças, reprodução e seu papel na economia mundial moderna. Plantas e produtos vegetais de importância industrial, plantas medicinais, plantas alimentícias, plantas psicoativas e aditivos alimentares são examinados.

Os alunos são expostos à evolução e à importância do pensamento evolutivo na biologia. Os tópicos incluem a teoria da evolução, como os processos evolutivos resultaram na diversidade da vida hoje e como o pensamento evolucionário pode informar suas vidas diárias.

Este curso explora as inter-relações ecológicas entre plantas e animais e as maneiras pelas quais eles usam produtos químicos para se comunicar, atrair parceiros e se proteger de predadores. Os tópicos incluem as adaptações químicas e morfológicas de defesa de insetos, toxinas vegetais e seus efeitos em animais, venenos de insetos e animais, alucinógenos vegetais e fúngicos, interações hormonais e químicas entre plantas e animais, feromônios animais e alelopatia vegetal e sua importância ecológica.


Ecologia e evolução de primatas moldadas por duas famílias de plantas mais consumidas

Macaco colobus vermelho (Piliocolobus tephrosceles) alimentando-se de folhas de leguminosas (Albizia) (Fabaceae). Crédito: Julie Kearney Wasserman

Ao analisar a proporção relativa de diferentes partes de plantas consumidas por primatas, os pesquisadores sugerem que os primatas podem ser intrincada e sutilmente moldados por duas famílias-chave de plantas: Moraceae e Fabaceae. O estudo, liderado por pesquisadores da University of Amsterdam e da Indiana University, destaca a importância de estudos dietéticos detalhados para entender melhor a ecologia e a evolução dos primatas. Os resultados agora estão publicados na revista científica Anais da Royal Society B.

Partes de plantas como folhas, frutos e sementes têm sido componentes essenciais da dieta de primatas por milhões de anos, mas a importância relativa das diferentes famílias de plantas permanece obscura. Portanto, os pesquisadores montaram um grande banco de dados e investigaram quais famílias de plantas são consumidas por primatas selvagens e quais famílias de plantas são mais importantes para a dieta de primatas em todo o mundo.

"Realizamos uma revisão estruturada da literatura e compilamos dados de> 230 estudos publicados para analisar a proporção relativa de diferentes partes de plantas consumidas pelos primatas", explica Dr. W. Daniel Kissling, pesquisador do Instituto de Biodiversidade e Dinâmica de Ecossistemas da UvA e sênior autor do estudo. De todos esses estudos, os pesquisadores registraram para cada planta a parte comida e a identidade taxonômica, estabelecendo, portanto, um grande banco de dados do consumo relativo de famílias de plantas em 112 espécies de primatas.

Os pesquisadores descobriram que as duas famílias de plantas mais consumidas pelos primatas são a família da amoreira (Moraceae), que inclui os figos amplamente conhecidos, e a família das leguminosas (Fabaceae), que inclui as ervilhas. Moraceae era comida por uma grande variedade de espécies de primatas, incluindo macacos-aranha, chimpanzés, gibões, macacos bugios, macacos colobus e gorilas, principalmente como frutas. Fabaceae, a terceira maior família de plantas em todo o mundo com quase 20.000 espécies conhecidas, era comida principalmente na forma de folhas, também por muitos primatas diferentes.

Chimpanzé comum (Pan troglodytes) alimentando-se de frutos de figo (Ficus) (Moraceae). Crédito: Julie Kearney Wasserman

“Fiquei surpreso que das 205 famílias de plantas registradas nas dietas de 112 primatas, apenas 10 são consumidas por mais da metade das espécies de primatas. Ainda mais surpreendente é que apenas duas famílias de plantas estão se destacando, sendo comidas por mais de 75% das espécies de primatas e fazendo juntos cerca de 13% das dietas de primatas em média ", diz Kissling.

“Meu interesse inicial neste estudo surgiu porque eu estava curioso para saber se as palmeiras tropicais, um grupo de plantas com o qual trabalhei por muitos anos, estão entre os alimentos mais importantes para os primatas”, explica Kissling. O banco de dados montado pelos pesquisadores registrou cerca de 40 espécies de primatas no mundo que de fato se alimentavam de frutas, flores e folhas de palmeiras. “Fiquei impressionado ao ver que algumas espécies de primatas, como o babuíno árabe ou o mangabey do rio Tana, têm mais de 20% de sua alimentação composta por uma única espécie de palmeira”, diz Kissling. "No entanto, ao longo das dietas dos 112 primatas, descobrimos que as palmeiras não estavam entre as dez primeiras famílias de plantas alimentícias dos primatas."

Ciência de dados em ecologia

O estudo mostra que sínteses baseadas em grandes bancos de dados globais têm grande potencial para obter novos insights sobre a ecologia e evolução de animais e outros organismos. “Há muito conhecimento coletivo por aí, mas muitas vezes não está disponível porque os dados ainda não foram reunidos de forma padronizada para torná-los localizáveis, acessíveis, interoperáveis ​​e reutilizáveis”, diz Kissling. Essa padronização é necessária porque os humanos dependem cada vez mais do suporte computacional para lidar com os dados como resultado do aumento no volume, complexidade e velocidade de criação dos dados. A ciência de dados e o gerenciamento de dados científicos estão, portanto, se tornando cada vez mais importantes na ecologia e na evolução. “Nós encorajamos os primatologistas e outros ecologistas a continuar com os estudos de campo sobre dietas animais e relatar as informações coletadas sobre os itens dietéticos de uma forma claramente organizada e padronizada, de preferência seguindo os padrões de dados e metadados existentes”, disse Kissling. "Isso permitirá futuras comparações entre estudos e expandir essas pesquisas sobre dietas para outras espécies, incluindo humanos", conclui Kissling.


Obtendo crédito por pesquisa

Se você trabalha 3 horas por semana ou mais em um laboratório, é elegível para se inscrever para receber crédito de pesquisa. Para obter crédito universitário, um Formulário de Proposta de Estudo Independente / Pesquisa Dirigida deve ser enviado ao seu orientador acadêmico até o 10º dia do semestre. Seu orientador irá inscrevê-lo no curso, bem como atribuir o valor do crédito a ser obtido.

Existem três tipos diferentes de crédito de pesquisa: Estudo Independente vs Pesquisa Dirigida vs Tese de Honra.

Estudo independente (199, 299, 399, 498, 499 crédito varia entre 1 e 6)
Alunos qualificados trabalhando individualmente com professores que se comprometeram a supervisionar esses trabalhos.

O seguinte se qualifica para unidades de estudo independentes:

Os alunos não recebem uma carta para estudo independente. Classes disponíveis: S / P, E, I, W

Pesquisa dirigida (392, 492 crédito varia entre 1-6)
Pesquisa individual ou em pequenos grupos sob a orientação de um docente.

Para receber unidades de pesquisa dirigidas, os alunos devem estar fazendo alguma contribuição intelectual para um projeto existente ou devem estar engajados em suas próprias pesquisas. Isto deveria não incluem tipos de experiências em que o aluno está realizando tarefas rotineiras. Para receber este crédito, você deve informar seu produto ao enviar a proposta. Os produtos apropriados incluem: um artigo, pôster ou apresentação para o grupo de laboratório demonstrando a profundidade de seu conhecimento adquirido e apresentando sua pesquisa. Uma combinação de produções é encorajada. Outros produtos são aceitáveis, conforme aprovado por seu consultor EEB.

As Unidades de Pesquisa Dirigida são destinadas a ser uma experiência de pesquisa personalizada na qual o aluno explora um conceito enquanto incorpora o conhecimento ou as técnicas de investigação aprendidas durante sua carreira de graduação. Esta experiência deve ser relevante para o trabalho principal e do curso de EEB ou Biologia. Deve também promover a compreensão do aluno sobre a disciplina de alguma forma. Isso normalmente inclui pesquisa e análise de informações relevantes para o grau do aluno. Os alunos devem estar engajados no assunto e na teoria. O contato frequente com membros do corpo docente e / ou pesquisadores principais é necessário para proporcionar um envolvimento mais avançado com o material.

Os alunos recebem uma nota de letra para unidades de pesquisa dirigida. Classes disponíveis: A, B, C, D, E
Pode ser repetido para um total de 12 créditos.

Estudo Independente - Honras (299H, 399H, 498H, 499H Crédito varia)
Alunos qualificados que trabalham individualmente com professores que se comprometeram a supervisionar esse trabalho. Os alunos devem estar no The Honors College para usar esses números de curso.

O departamento de EEB exige que essas unidades sigam a política de honras para crédito listada em https://www.honors.arizona.edu/indidivual-studiesresearchinternship:

"Os estudos independentes com honras (identificados por um“ H ”após o número do curso) são diferentes das seções não-honras porque recebem uma nota normal após a conclusão, significando que a profundidade e intensidade do trabalho excede o escopo de uma estudo independente. Ao escolher inscrever um aluno para um estudo independente com distinção, o corpo docente deve levar em consideração o seguinte:

Um estudo independente honorário deve ser qualitativamente diferente do estudo independente não honorário normalmente realizado no departamento. Mesmo no ambiente de laboratório, o aluno de Honras que faz uma seção de Honras de estudo independente deve estar fazendo um trabalho comprovadamente diferente do que os alunos registrados para uma seção de não-Honras de 199-499. Esta diferença, indicando que o estudo independente é digno da designação de honras e, portanto, de uma nota, deve ser indicada e descrita na ficha departamental para crédito. Este “trabalho comprovadamente diferente” não deve significar atribuições adicionais, mas um envolvimento mais profundo, mais desafiador e mais intenso com o assunto ou trabalho do estudo independente.O corpo docente em departamentos individuais deve determinar, junto com seus colegas da disciplina, o que este trabalho específico e mais desafiador deve ser, mas em geral pode envolver alguns ou todos os seguintes: envolvimento com a teoria, contato mais próximo e / ou mais frequente com membros do corpo docente e / ou investigadores principais, interrogatório de suposições subjacentes e sabedoria recebida, envolvimento mais avançado com o material, progresso mais rápido através do currículo do curso e assim por diante. Apenas os alunos com honras de universidade ativos devem ser registrados para estudos independentes com honras. "

Para receber o crédito do Honors Independent Study, você deve declarar seu produto ao enviar a proposta. Os produtos apropriados incluem: um artigo, pôster ou apresentação para o grupo de laboratório demonstrando a profundidade de seu conhecimento adquirido e apresentando sua pesquisa. Uma combinação de produções é encorajada. Outros produtos são aceitáveis, conforme aprovado por seu consultor EEB.

Classes disponíveis: A, B, C, D, E, I, W
Pode ser repetido um número ilimitado de vezes, consulte o departamento para possíveis restrições.

Tese de Honra (498H 3 créditos)
O Departamento de EEB exige que as unidades de Teses de Honra sigam a política de honras descrita aqui: https://www.honors.arizona.edu/capstone. As unidades de Honors Thesis estão sujeitas a um prazo mais cedo e a padrões mais rigorosos do que o Honors Independent Study. Resumidamente:

"A Tese de Honras Sênior é o culminar da participação de um aluno no The Honors College da University of Arizona. Ela se destina a ser uma experiência de pesquisa personalizada na qual o aluno explora um conceito enquanto incorpora o conhecimento ou as técnicas investigativas aprendidas durante sua carreira de graduação.

Espera-se que o aluno obtenha um nível de aprofundamento dentro do tema da tese equivalente a um ponto entre um grande trabalho de iniciação científica e uma dissertação de mestrado. A tese não deve apenas sintetizar e desenvolver estudos existentes, mas também deve promover a compreensão da disciplina sobre o assunto de alguma forma. Como tal, a tese exige um mínimo de seis unidades de trabalho - três unidades de Honras Departamentais 498H por semestre, geralmente tomadas no último ano. Sob nenhuma circunstância os alunos terão permissão para concluir todas as unidades de seis teses em um único semestre."

Os alunos recebem uma nota de letra para unidades de Tese de Honra. O aluno receberá uma nota de carta para o trabalho de cada semestre. O Honors College recomenda que o trabalho e a avaliação sejam divididos de forma que todas as seis unidades não dependam da tese concluída.

O Departamento EEB requer unidades de Tese de Honra para cobrir um tópico relacionado ao major. A relevância do tópico e o nível apropriado de rigor (julgado pela contribuição intelectual do aluno e coleta e análise de dados originais) são avaliados pelos Orientadores de Graduação da EEB.


Alcance

Biologia Evolutiva do Desenvolvimento hospeda artigos que cobrem todos os aspectos das causas e consequências da evolução do desenvolvimento.

Abordar essas questões envolve a investigação da origem e estrutura da variação entre populações e espécies, as formas diversas e frequentemente complexas em que o desenvolvimento é controlado por genes, o genótipo ao mapa de fenótipo e como a variação genética leva a diferenças nas redes reguladoras de genes, processos de desenvolvimento, biologia celular e comportamento, e os fenótipos dos organismos. Isso abrange como o desenvolvimento evolui e fundamenta a diversidade, as forças evolutivas envolvidas e todos os aspectos em que estas envolvem interações com o meio ambiente, tanto no sentido instrutivo quanto seletivo, bem como na reconstrução e inferência das características ancestrais dos organismos.

Qualquer abordagem relevante é bem-vinda, desde que a teoria evolutiva, modelagem matemática, genética, expressão gênica e estudos de função, investigações morfométricas, estudos biomecânicos, análises morfológicas comparativas, bioimagem ou uma combinação dos mesmos, sejam frutificamente aplicados para resolver questões evo-devo.

Também aceitamos manuscritos que abordem as relações entre a teoria da evolução e o núcleo conceitual da biologia do desenvolvimento, bem como discussões teóricas e metodológicas sobre evolucionabilidade e inovações evolutivas, bem como sobre homologia, convergência, heterocronia e outros conceitos centrais, desde que essas noções sejam abordado em uma perspectiva evo-devo integrada.


Caracterizando a seleção natural

A maior parte do trabalho atual que tenta medir a seleção natural dentro das populações, ou seja, para descrever a relação entre características e aptidão relativa, baseia-se no trabalho seminal de Robertson (1966), Price (1970) e Lande & Arnold (1983). Esses estudos mostraram elegantemente como a seleção pode ser representada como uma covariância entre uma característica e aptidão relativa (Price 1970), como uma resposta à seleção requer uma covariância genética entre os valores genéticos para uma característica e aptidão (Robertson 1966 Price 1970), e como total a seleção pode ser dividida em seleção direta em uma característica e seleção indireta por meio de características correlacionadas (Lande & Arnold 1983). Coletivamente, esses artigos geraram uma enorme literatura dedicada a abordagens conceituais, metodológicas, estatísticas e até filosóficas para estimar e particionar as covariâncias fenotípicas e genéticas entre características e alguns aspectos da aptidão relativa. Três artigos nesta edição esclarecem aspectos não resolvidos desta literatura de maneiras significativas e importantes.

Primeiro, Franklin e Morrissey (2017) consideram a questão complicada do que fazer quando só se pode obter um proxy para aptidão, como tamanho do corpo, biomassa ou taxa de crescimento. Seu trabalho se baseia em uma estrutura clássica desenvolvida por Arnold (1983). Eles descobriram que usar o desempenho em vez da aptidão relativa refletirá apenas a seleção verdadeira sob condições limitadas e pode levar a subestimativas graves da seleção. Thomson & Hadfield (2017) consideram o que é, de certa forma, a questão oposta: quando se tem vários componentes de fitness, quais pertencem a quem? Deve-se considerar a sobrevivência da prole como componentes de aptidão de sua própria geração (prole) ou como parte da aptidão de seus pais? E como explicar o fato de que os fenótipos parentais podem afetar não apenas sua própria fecundidade, mas também a sobrevivência de seus descendentes? Eles mostram que o uso de componentes de aptidão da prole como parte da aptidão dos pais ("aptidão mista" em seus termos) é comum em estudos de pássaros e mamíferos, mas só levará a estimativas corretas de seleção e mudança evolutiva sob condições muito restritivas. Esses documentos não só oferecem orientação quantitativa e estatística para investigadores com dados semelhantes, mas também têm implicações importantes para tentativas de prever respostas evolutivas e para interpretar os resultados de meta-análises de seleção (por exemplo, Kingsolver et al. 2012). Uma complicação adicional surge quando o fenótipo de um indivíduo é ele próprio afetado pelos indivíduos (potencialmente relacionados) com os quais ele interage. Hadfield & Thomson (2017) desenvolvem métodos para entender a seleção nesses contextos em relação aos custos e benefícios de Hamilton (Hamilton 1964). Um resultado importante de seu estudo é uma versão multivariada da regra de Hamilton: eles derivam condições nas quais o altruísmo pode evoluir em contextos de múltiplas características. Coletivamente, esses três artigos contribuem para a compreensão da seleção natural, esclarecendo algumas das questões-chave relacionadas à medição da seleção em populações contemporâneas: o que é aptidão, de quem é aptidão, de quem é o fenótipo e como as interações com indivíduos relacionados podem moldar a evolução de traços múltiplos. É importante ressaltar que todos os três documentos contêm recomendações firmes, teoria e métodos estatísticos para orientar o campo.


BIOL - Biologia

Cursos numerados de 100 a 299 = divisão inferior 300 a 499 = Divisão superior 500 a 799 = graduação / pós-graduação.

BIOL 106. The Human Organism (3).

Curso geral de matemática e ciências naturais. Apresenta a não-ciência principal a certos princípios biológicos conforme eles se relacionam com o organismo humano, fornece informações biológicas e compreensão de assuntos que são relevantes para o próprio bem-estar e papel do aluno como cidadão mundial, e aumenta a consciência do lugar humano na biosfera . A inscrição simultânea ou subsequente no BIOL 107 é recomendada para alunos que precisam de crédito de educação geral para uma experiência de laboratório de ciências naturais. O crédito para este curso não pode ser aplicado aos requisitos de especialização ou menor em ciências biológicas. Apenas um dos seguintes itens pode ser levado para crédito: BIOL 104, 105, 106 e / ou 107. Os alunos que desejam repetir o BIOL 105 (não mais oferecido) devem se inscrever no BIOL 106 e 107.

BIOL 107. The Human Organism Laboratory (1).

2 horas de laboratório. Curso geral de matemática e ciências naturais. Para os não especializados em ciências. Complementa e reforça o material coberto em BIOL 106 com uma experiência de laboratório. Usa uma abordagem prática e cobre tópicos relevantes para os alunos e seu papel na biosfera. Os tópicos incluem estrutura celular, sistemas de órgãos humanos, o papel dos microrganismos no meio ambiente, metabolismo, genética e câncer. Não requer dissecção de animais. O crédito para este curso não pode ser aplicado aos requisitos de especialização ou menor em ciências biológicas. Apenas um dos seguintes itens pode ser levado para crédito: BIOL 104, 105, 106 e / ou 107. Os alunos que desejam repetir o BIOL 105 (não mais oferecido) devem se inscrever no BIOL 106 e 107.

BIOL 210. Biologia Geral I (4).

3 horas de aula 3 horas de laboratório. Curso geral de matemática e ciências naturais. Apresenta conceitos fundamentais em biologia celular e molecular. Inclui química biológica básica célula e estrutura de membrana e função aeróbica e anaeróbia vias respiratórias metabolismo intermediário e regulação de fotossíntese de atividades celulares em níveis genéticos e proteicos mecanismos de reprodução celular de herança em níveis moleculares, organísmicos e populacionais filogenia e evolução. O laboratório desenvolve competências no método experimental, procedimentos laboratoriais básicos e comunicação escrita de informação científica utilizando tópicos relacionados com as aulas teóricas. Os alunos não podem receber crédito para BIOL 204 (não mais oferecido) e BIOL 210. Os alunos que desejam repetir o BIOL 204 podem se inscrever neste curso, sujeito às limitações de crédito indicadas acima. Co-requisito (s): BIOL 210L, CHEM 211 recomendado.

BIOL 211. Biologia Geral II (4).

3 horas de aula 3 horas de laboratório. Curso geral de matemática e ciências naturais. Apresenta conceitos fundamentais de biologia conforme eles se aplicam a níveis de organização de organismos através de ecossistemas. Concentra-se na morfologia, fisiologia, diversidade e ecologia dos organismos. Apresenta o crescimento e a anatomia, o transporte de materiais, os mecanismos reguladores e a reprodução nas plantas, também a aquisição de nutrientes, a circulação, a regulação neural e hormonal, a reprodução, as respostas imunológicas e o comportamento dos animais. Os princípios de ecologia apresentados incluem crescimento e regulação populacional, interações interespecíficas e cadeias alimentares, e fluxo de energia e ciclo de material através dos ecossistemas. O laboratório inclui um levantamento da diversidade de organismos, incluindo procariotos, protistas, fungos, plantas e animais. Enfatiza as tendências evolutivas nos reinos vegetal e animal. Pré-requisito (s): BIOL 210. Co-requisito (s): Recomenda-se a inscrição simultânea no BIOL 211L no CHEM 212.

BIOL 220. Introdução à Microbiologia (4).

3 horas de aula 2 horas de laboratório. Curso geral de matemática e ciências naturais. Para estudantes em áreas afins da saúde. Introduz microorganismos eucarióticos e procarióticos e vírus e desenvolve uma compreensão do crescimento microbiano, incluindo o uso de antissépticos, desinfetantes e antibióticos DNA como material genético, incluindo replicação de DNA, síntese de proteínas, regulação gênica, mutação e troca gênica em bactérias aplicadas e microbiologia ambiental incluindo tratamento de água e esgoto e resistência à infecção da microbiologia de alimentos, mecanismos básicos de patogênese e doenças microbianas selecionadas. O laboratório reforça os conceitos aprendidos na aula e ajuda o aluno a compreender e desenvolver competência em técnicas microbianas básicas, incluindo o manuseio seguro de microrganismos. O crédito obtido neste curso não pode ser aplicado aos requisitos de especialização ou secundária em ciências biológicas. Os alunos podem não receber crédito para o BIOL 120 (não mais oferecido) e para o BIOL 220. Os alunos que desejam repetir o BIOL 120 podem se inscrever neste curso. Pré-requisito (s): CHEM 101 ou 103 ou 211. Co-requisito (s): BIOL 220L.

BIOL 223. Human Anatomy and Physiology (5).

4 horas de aula 2 horas de laboratório. Curso geral de matemática e ciências naturais. Apresenta a estrutura e função dos principais sistemas do corpo humano. Demonstra a estrutura e função de certos sistemas posteriormente no ambiente de laboratório. Para alunos com especialização em programas que não sejam ciências biológicas ou bioquímica. Os alunos que concluíram o BIOL 225 ou 226 (ambos não são mais oferecidos) podem não receber crédito pela inscrição anterior nesses cursos e subsequente inscrição no BIOL 223. Os alunos que desejam repetir o BIOL 225 ou 226 podem se inscrever neste curso, sujeito às limitações de crédito indicado acima. Os alunos podem receber crédito para apenas um dos seguintes: HS 290 ou BIOL 223. Pré-requisito (s): CHEM 101 ou 103 ou 211. Co-requisito (s): BIOL 223L.

BIOL 309. Foundations of Human Heredity (3).

Curso geral de matemática e ciências naturais. Apresenta os mecanismos e significado social do desenvolvimento, transmissão e genética populacional de humanos. Chama a atenção para os erros inatos do metabolismo e do desenvolvimento e para os papéis do aconselhamento genético e da engenharia genética em seu manejo. Projetado para alunos que se especializam fora das ciências naturais e não podem levar crédito em ciências biológicas principais ou secundárias.

BIOL 309H. Fundamentos das honras da hereditariedade humana (3).

Curso geral de matemática e ciências naturais. Apresenta os mecanismos e significado social do desenvolvimento, transmissão e genética populacional de humanos. Chama a atenção para os erros inatos do metabolismo e do desenvolvimento e para os papéis do aconselhamento genético e da engenharia genética em seu manejo. Projetado para estudantes que se especializam fora das ciências naturais e não podem levar crédito em ciências biológicas principais ou secundárias.

BIOL 310. Reprodução Humana: Questões e Perspectivas (3).

Curso geral de matemática e ciências naturais. Levantamento abrangente dos muitos aspectos biológicos da reprodução. Abrange a estrutura e função do sistema reprodutivo, bem como informações sobre fertilização in vitro, testes de fertilidade, contracepção, problemas populacionais, AIDS, câncer, questões reprodutivas, problemas éticos e outras preocupações sobre o controle da reprodução humana.

BIOL 330. Microbiologia Geral (5).

3 horas de aula 6 horas de laboratório. Apresenta a estrutura, função, sistemática, ecologia e dinâmica populacional de microrganismos com ênfase em procariotos. Pré-requisito (s): BIOL 204 (não mais oferecido) ou 211, CHEM 212. Co-requisito (s): BIOL 330L.

BIOL 360. Como a evolução explica o mundo vivo (3).

Curso geral de matemática e ciências naturais. Ajuda os alunos a compreender a complexidade e a unidade da vida através das lentes da evolução. Os alunos investigam a biodiversidade do mundo vivo e como os fósseis e as filogenias se relacionam com essas espécies. Os alunos também praticam a revisão da literatura primária e como discutir tópicos potencialmente delicados com não-cientistas. O curso termina com uma discussão esclarecedora sobre o conceito de raça em humanos.

BIOL 370. Ciência Ambiental Introdutória (3).

Curso geral de matemática e ciências naturais. Examina a relação das populações humanas da Terra com o uso / esgotamento de recursos e com o impacto das atividades humanas no meio ambiente. Apresenta e usa conceitos básicos relativos à energia, populações e ecossistemas como base para a compreensão dos problemas ambientais nos níveis local, regional, nacional e internacional. O curso inclui conteúdo de diversidade.

BIOL 408. Biologia do Envelhecimento (3).

Listado como AGE 408. Uma introdução ao fenômeno do envelhecimento, incluindo um levantamento dos processos e mecanismos de senescência relacionados à idade, enfatizando os humanos. Pré-requisito (s): um curso básico em biologia que satisfaça os requisitos gerais de educação.

BIOL 418. Ecologia Geral (4).

3 Horas de aula 3 Horas de laboratório. Princípios subjacentes às inter-relações dos organismos vivos e seus ambientes, desde a biosfera até o nível de organização da população. Alguns exercícios de laboratório e projetos de aula realizados em locais de campo locais. O curso inclui conteúdo de diversidade. Pré-requisito (s): BIOL 204 (não mais oferecido) ou 211, CHEM 212. Co-requisito (s): BIOL 418L.

BIOL 419. Genética (4).

3 horas de aula 3 horas de laboratório. Os mecanismos de hereditariedade e variação em animais, plantas e procariontes com uma revisão crítica da estrutura e função dos genes. Pré-requisito (s): BIOL 204 (não mais oferecido) ou 211, CHEM 212. Co-requisito (s): BIOL 419L.

BIOL 420. Molecular Cell Biology (4).

3 horas de aula 3 horas de laboratório. Preocupado principalmente com a biologia molecular das células eucarióticas. Abrange componentes celulares individuais (organelas) e processos, incluindo a membrana plasmática, mitocôndria e conversão de energia, classificação intracelular, o núcleo da célula e mecanismos genéticos, controle da expressão gênica, sinalização celular, crescimento e divisão celular, câncer e mecanismos celulares de desenvolvimento. Revê e demonstra técnicas atuais e abordagens experimentais para estudar células. Pré-requisito (s): BIOL 204 (não é mais oferecido) ou 211, CHEM 212. Co-requisito (s): BIOL 420L.

BIOL 481. Educação Cooperativa (1-4).

O curso complementa e aprimora o programa acadêmico do aluno, proporcionando uma oportunidade de aplicar o conhecimento adquirido por meio do curso a situações relacionadas ao trabalho. Para informações, entre em contato com o coordenador de graduação ou com a secretaria do programa de educação cooperativa. Não mais do que 4 horas de crédito ganhas em BIOL 481 podem ser aplicadas para satisfazer os requisitos de especialização em ciências biológicas. Pré-requisito (s): candidato e posição de educação cooperativa aprovada pelo comitê de assuntos departamentais.

BIOL 481N. Estágio (2-3).

Complementa e aprimora o programa acadêmico do aluno, proporcionando uma oportunidade de aplicar e adquirir conhecimentos em um ambiente de trabalho como estagiário. Pré-requisito (s): consentimento departamental.

BIOL 497. Biology Colloquium (1).

Seminários de pesquisa apresentados por alunos de pós-graduação, professores e pesquisadores visitantes. Requer um trabalho escrito sobre um dos tópicos apresentados. Repetível uma vez para crédito. Pré-requisito (s): dois dos seguintes - BIOL 418, 419, 420.

BIOL 498. Leitura Independente de Graduação (1-2).

Os alunos realizam bolsa de estudos sob a supervisão direta do corpo docente e redigem um relatório.Não mais do que 6 horas de crédito ganhas com BIOL 498, 499 ou cursos de estudo independente equivalentes podem ser aplicadas para atender aos requisitos de graduação do departamento. Pré-requisito (s): pelo menos 20 horas de crédito de curso de biologia que satisfaça os requisitos principais, consentimento do instrutor, um formulário de Resumo de Estudo Independente Direcionado e consentimento do departamento.

BIOL 499. Pesquisa de Graduação (1-4).

Os alunos realizam bolsa de estudos sob a supervisão direta do corpo docente e redigem um relatório. Não mais do que 6 horas de crédito ganhas com BIOL 498, 499 ou cursos de estudo independente equivalentes podem ser aplicadas para atender aos requisitos de graduação do departamento. Pré-requisito (s): pelo menos 20 horas de crédito de curso de biologia que satisfaça os requisitos principais, consentimento do instrutor, um formulário de Resumo de Estudo Independente Direcionado e consentimento do departamento.

BIOL 502. Vascular Plants (4).

2 horas de aula 4 horas de laboratório. Apresenta a estrutura, reprodução e evolução dos principais grupos de plantas vasculares vivas e extintas. Inclui uma introdução à sistemática das plantas com flores. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação realizam uma pesquisa primária de literatura sobre um tópico selecionado em consulta com o instrutor e fazem uma apresentação oral de 30 minutos para a classe. Pré-requisito (s): BIOL 204 (não é mais oferecido) ou BIOL 211, CHEM 212.

BIOL 503. Botânica de campo (4).

Apresenta a identificação de campo de plantas com flores comuns usando chaves técnico-científicas, padrões de distribuição e princípios gerais de taxonomia. Além de palestras e atividades de laboratório, inúmeras viagens de campo desenvolvem habilidades botânicas e reforçam os princípios abordados nas palestras. Pré-requisito (s): BIOL 211, CHEM 212 ou licença de instrutor.

BIOL 510. Gerenciamento e restauração de ecossistemas (3).

Examina a concepção, implementação e avaliação de planos de gestão de terras e projetos de restauração. Estudos de caso de restauração cobrindo uma ampla gama de sistemas ecológicos (por exemplo, pastagens, florestas, pântanos, aquáticos e marinhos) são usados ​​para examinar os pontos fortes e fracos de diferentes abordagens nesses contextos, com atenção particular aos princípios ecológicos e realidades socioeconômicas. Os alunos elaboram um plano de manejo por escrito para um local no centro-sul do Kansas. O curso inclui conteúdo de diversidade. BIOL 418 é recomendado. Pré-requisito (s): BIOL 211 ou permissão do instrutor.

BIOL 524. Vertebrate Zoology (3).

Evolução, distribuição, história natural e personagens especiais dos animais vertebrados. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação produzem um trabalho de conclusão de curso com base na literatura técnica sobre um tópico escolhido em consulta com o instrutor. Pré-requisito (s): BIOL 204 (não é mais oferecido) ou BIOL 211, CHEM 212 BIOL 527 também é recomendado.

BIOL 527. Anatomia Comparada (5).

3 horas de aula 4 horas de laboratório. Estudo intensivo de cordados representativos enfatizando a anatomia dos vertebrados. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação realizam tarefas adicionais escolhidas em consulta com o instrutor, como um trabalho de conclusão de curso baseado em literatura técnica, dissecação de animais adicionais, etc. Pré-requisito (s): BIOL 211 e CHEM 212. Requisito (s): BIOL 527L.

BIOL 528. Parasitologia (4).

2 horas de aula 4 horas de laboratório. Estuda os parasitas do homem e outros hospedeiros vertebrados. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação produzem um trabalho de conclusão de curso com base na literatura técnica sobre um tópico escolhido em consulta com o instrutor. Pré-requisito (s): BIOL 204 (não é mais oferecido) ou BIOL 211, CHEM 212.

BIOL 530. Microbiologia Aplicada e Ambiental (3).

Uma caracterização das funções dos micróbios em ambientes naturais e artificiais. Discussões de ecologia microbiana e comunidades, inter-relações com organismos superiores, ciclo biogeoquímico, biotecnologia e biorremediação. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação produzem um artigo de pesquisa adicional com base na literatura primária sobre um tópico escolhido em consulta com o instrutor. Pré-requisito (s): BIOL 204 (não mais oferecido) ou BIOL 211, CHEM 212.

BIOL 532. Entomologia (4).

2 horas de aula 4 horas de laboratório. Apresenta a morfologia, fisiologia, ciclos de vida, comportamento, ecologia e importância econômica dos insetos. Os alunos que obtêm crédito de pós-graduação produzem um trabalho de conclusão de curso com base na literatura técnica sobre um tópico escolhido em consulta com o instrutor ou desenvolvem proficiência em um táxon específico realizando um projeto de sistemática individual. Pré-requisito (s): BIOL 204 (não mais oferecido) ou BIOL 211, CHEM 212.

BIOL 534. Human Physiology (3).

Abordagem dos sistemas de órgãos à fisiologia humana. Enfatiza os sistemas de controle nervoso e endócrino e a coordenação das funções corporais. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação submetem um trabalho de conclusão de curso com base em pesquisa da biblioteca sobre um tópico em fisiologia humana escolhido em consulta com o instrutor. Pré-requisito (s): BIOL 204 (não mais oferecido) ou BIOL 211, CHEM 531 ou consentimento do instrutor.

BIOL 535. Laboratório de Fisiologia Humana (2).

4 horas de laboratório. Abordagem empírica da fisiologia humana. Os alunos que buscam crédito de pós-graduação submetem um relatório laboratorial adicional relacionando os resultados de um experimento de laboratório àqueles encontrados na literatura técnica atual. Pré ou co-requisito (s): BIOL 534.

BIOL 540. Biologia do Desenvolvimento (4).

2 horas de aula 4 horas de laboratório. Processos de desenvolvimento em animais com ênfase em vertebrados. Centrado nas interações celulares que controlam a diferenciação e morfogênese. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação realizam tarefas adicionais escolhidas em consulta com o instrutor. Pré-requisito (s): BIOL 204 (não mais oferecido) ou BIOL 211, CHEM 212. BIOL 420 recomendado. Co-requisito (s): BIOL 540L.

BIOL 560. Plant Ecology (2).

2 horas de aula. Examina a relação das plantas com seu ambiente nos níveis de organismo, população, comunidade e ecossistema. Para obter crédito de pós-graduação, o aluno deve preparar e apresentar uma palestra de 30 minutos sobre um dos tópicos abordados neste curso. Pré-requisito (s): BIOL 418 e CHEM 212 ou consentimento do instrutor.

BIOL 561. Laboratório de Ecologia Vegetal (2).

Componente laboratorial do BIOL 560. As viagens de campo são parte integrante do curso. Enfatiza uma abordagem experimental à ecologia de plantas. Para crédito de pós-graduação, o aluno deve apresentar os resultados do projeto de biblioteca / laboratório oralmente, bem como por escrito. Pré ou co-requisito (s): BIOL 560.

BIOL 570. Biologia da Conservação (3).

Examina a aplicação de conceitos fundamentais em ecologia, biologia evolutiva e genética para a preservação da diversidade biológica ao nível de genótipos, espécies e ecossistemas. Os tópicos abordados incluem (1) como os biólogos quantificam a diversidade biológica, (2) ameaças à diversidade biológica, (3) ferramentas usadas para avaliar o nível de ameaça às espécies individuais e para projetar planos de manejo de espécies e (4) conceitos e considerações para preservar Projeto. As decisões relacionadas à conservação da biodiversidade geralmente têm consequências sociais e econômicas. Os alunos exploram essas complexidades por meio de estudos de caso. As habilidades desenvolvidas neste curso incluem leitura crítica da literatura científica primária, redação científica e apresentação oral. Pré-requisito (s): BIOL 418.

BIOL 575. Ecologia de campo (3).

9 horas de laboratório. Técnicas de análise de sistemas constituídos por organismos vivos e seus ambientes. Viagens de campo são obrigatórias. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação realizam um projeto individual sobre a estrutura comparativa da comunidade e relatam os resultados em um artigo técnico. Pré-requisito (s): BIOL 418 ou consentimento do instrutor.

BIOL 590. Immunobiology (3).

A natureza dos antígenos e anticorpos e suas interações. Inclui aspectos celulares e humorais de fenômenos imunológicos. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação preparam um trabalho de conclusão de curso com base na literatura técnica sobre um tópico escolhido em consulta com o instrutor. Pré-requisito (s): BIOL 204 (não mais oferecido) ou 211, CHEM 531.

BIOL 610. Tópicos em Botânica (1-5).

Ofertas selecionadas em botânica. Consulte a Programação de Cursos para as ofertas atuais. Os alunos que desejam se inscrever em cursos não listados no cronograma atual devem preencher um formulário de Resumo de estudo independente dirigido e obter aprovação antes da inscrição. Os alunos que recebem crédito de pós-graduação produzem um trabalho de conclusão de curso com base na literatura técnica sobre um tópico escolhido em consulta com o instrutor. Repetível para crédito. Pré-requisito (s): BIOL 204 (não mais oferecido) ou BIOL 211, CHEM 212 e consentimento do instrutor.

BIOL 610A. Laboratório de Biologia Celular e Molecular (1).

Adquirir técnicas atuais e abordagens experimentais para estudar células. Pré-requisito (s): aprovação departamental.

BIOL 610M. Tópicos no Laboratório de Genética (1).

Os alunos adquirem conhecimentos em técnicas genéticas atuais e sabem como aplicar esse conhecimento para analisar dados genéticos, o que ajuda a melhorar suas habilidades de resolução de problemas. Pré-requisito (s): aprovação departamental.

BIOL 610N. Palestra e Laboratório de Ecologia Vegetal (4).

Concentra-se na identificação e explicação dos principais padrões ecológicos encontrados em populações e comunidades de plantas.

BIOL 626. Biologia Reprodutiva (3).

Abrange a organização básica e função dos sistemas reprodutivos de vertebrados. Inclui conceitos atuais e pesquisas contemporâneas do nível molecular ao populacional. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação preparam um trabalho de conclusão de curso com base na literatura técnica sobre um tópico escolhido em consulta com o instrutor. BIOL 526 é fortemente recomendado. Pré-requisito (s): BIOL 420.

BIOL 640. Tópicos em Zoologia (1-4).

Ofertas selecionadas em zoologia. Consulte a Programação de Cursos para a (s) oferta (s) atual (is). Os alunos que desejam se inscrever em cursos não listados no cronograma atual devem preencher um formulário de Resumo de estudo independente dirigido e obter aprovação antes da inscrição. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação produzem um trabalho de conclusão de curso com base na literatura técnica sobre um tópico escolhido em consulta com o instrutor. Repetível para crédito. Pré-requisito (s): BIOL 204 (não mais oferecido) ou BIOL 211, CHEM 212 e consentimento do instrutor.

BIOL 640AA. Laboratório de Ecologia (1).

Laboratório explora os princípios subjacentes às inter-relações dos organismos vivos e seus ambientes, desde a biosfera até o nível de organização populacional. Pré-requisito (s): aprovação departamental.

BIOL 640AB. Anatomia Humana (3).

Oferece aos alunos uma compreensão da anatomia do corpo humano no nível 600. A ênfase está na anatomia estrutural detalhada e na classificação de cada um dos sistemas de órgãos do corpo humano. Os alunos são desafiados a começar a pensar clinicamente para se preparar para um futuro nas profissões da saúde. Inclui aulas teóricas semanais e laboratórios que o aluno deverá frequentar. Co-requisito (s): BIOL 640AL.

BIOL 640AC. Endocrinologia (3).

Regulação de processos fisiológicos em vertebrados por hormônios mensageiros químicos e fatores de crescimento. Pré-requisito (s): BIOL 211, CHEM 212 e consentimento do instrutor.

BIOL 640AL. Laboratório de anatomia humana (2).

A anatomia macroscópica e microscópica de cada sistema do corpo humano é examinada em laboratório por meio do uso de modelos, diagramas, atividades de laboratório e dissecações. As dissecções incluem dissecção total de fetos de porco e dissecações de órgãos dos seguintes órgãos de ovelha: cérebro, globo ocular, coração e rim. Co-requisito (s): BIOL 640AB.

BIOL 640CA. Herpetologia (3).

Evolução, ecologia e história natural de anfíbios e répteis com laboratório que cobre a anatomia geral e a identificação e história natural de todas as espécies nativas de anfíbios e répteis no Kansas. As viagens de campo opcionais exploram áreas regionais de interesse herpetológico e incluem atividades como a exploração de coros de sapos, cruzeiros rodoviários e trabalho de campo geral relacionado à teoria de amostragem, técnicas de amostragem e identificação de anfíbios e répteis. Pré-requisito (s): BIOL 211 e CHEM 212.

BIOL 640CB. Zoologia de Vertebrados de Campo (4).

Abrange a evolução geral, ecologia e história natural dos vertebrados do Kansas. Combina a história natural básica de uma ampla variedade de famílias de vertebrados do Kansas com trabalho de campo geral, teoria de amostragem, técnicas de amostragem e abordagens para identificação específica de táxons. Pré-requisito (s): BIOL 211 e CHEM 212, ou consentimento do instrutor.

BIOL 640CL. Laboratório de Herpetologia (1).

Abrange a anatomia geral e a identificação e história natural de todas as espécies nativas de anfíbios e répteis no Kansas. As viagens de campo opcionais exploram áreas regionais de interesse herpetológico e incluem atividades como a exploração de coros de sapos, cruzeiro rodoviário e trabalho de campo geral relacionado à teoria de amostragem, técnicas de amostragem e identificação de anfíbios e répteis. Pré-requisito (s): BIOL 211 e CHEM 212. Co-requisito (s): BIOL 640CA.

BIOL 640G. Tópicos em Neurobiologia (3).

O curso cobre neuroanatomia fundamental, neurociência celular e molecular, desenvolvimento, sistemas sensoriais, sistemas motores e sistemas regulatórios.

BIOL 640OL. ST: Biologia Geral I - Laboratório (1).

Biologia é uma ciência laboratorial e a parte laboratorial da Biologia Geral I apresenta aos alunos métodos experimentais e comunicação científica. Pré-requisito (s): aprovação departamental.

BIOL 640P. Evolução (3).

Os alunos deste curso aprenderão os aspectos básicos do padrão evolutivo e do processo com foco nas mudanças dentro das populações. Os tópicos incluem: 1) uma visão geral da seleção natural e seus efeitos 2) o processo micro evolutivo em populações naturais (deriva, seleção, mutação, etc.) 3) genética quantitativa 3) teste de hipóteses de adaptação 4) a evolução dos genomas e 5 ) divergência de linhagem (especiação).

BIOL 640QL. ST: Biologia Geral II - Laboratório (1).

O laboratório inclui um levantamento da diversidade de organismos, incluindo procariotos, protistas, fungos, plantas e animais. Pré-requisito (s): aprovação departamental.

BIOL 660. Tópicos em Microbiologia (1-4).

Ofertas selecionadas em botânica. Consulte a Programação de Cursos para as ofertas atuais. Os alunos que desejam se inscrever em cursos não listados na programação atual devem preencher um formulário de Resumo de estudo independente dirigido e obter aprovação antes da inscrição. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação produzem um trabalho de conclusão de curso com base na literatura técnica sobre um tópico escolhido em consulta com o instrutor. Repetível para crédito. Pré-requisito (s): BIOL 330 e consentimento do instrutor.

BIOL 660J. Laboratório de Microbiologia Geral (2).

Serão realizadas habilidades práticas de laboratório de microbiologia geral, incluindo microscopia, coloração, técnicas assépticas e de cultura, isolamento e identificação de espécies bacterianas e outras técnicas padrão usadas em microbiologia. Pré-requisito (s): aprovação departamental.

BIOL 660K. Astrobiologia (3).

Examina a literatura primária em astrobiologia. Os alunos apresentam e discutem as revisões desses relatórios do ponto de vista científico e editorial. Os alunos bem sucedidos adquirem um conhecimento aprofundado dos conceitos e métodos da astrobiologia. Concentra-se nos aspectos microbianos da astrobiologia, incluindo proteção planetária, vida em ambientes extremos, habitabilidade e detecção de vida. Os tópicos podem variar e se estender a missões povoadas de longa duração, sistemas de suporte de vida bioregenerativo e pesquisa de microgravidade. Pré-requisito (s): BIOL 210, BIOL 211, CHEM 211 e CHEM 212.

BIOL 661. Microbiologia Patogênica (3).

Concentra-se nos micróbios que produzem doenças. A maior parte da cobertura é dada aos micróbios que causam doenças em humanos, mas as doenças zoonóticas também são cobertas. Além de descrever as características de cada micróbio que possibilitam sua patogênese, é dada atenção aos aspectos distintos de sua epidemiologia, seus meios de disseminação e contra-medidas eficazes. Pré-requisito (s): BIOL 330 ou consentimento do instrutor.

BIOL 662. Virology (3).

Concentra-se nos seguintes aspectos dos vírus: estrutura, função, estratégia de replicação, interações da célula hospedeira e mecanismo de variabilidade. Tópicos adicionais incluem a coevolução de vírus e suas células hospedeiras, o nicho ecológico exclusivo ocupado por vírus e o desafio que os vírus apresentam ao tentar estabelecer distinções claras entre entidades vivas e não vivas. Pré-requisito (s): BIOL 330 ou consentimento do instrutor.

BIOL 666. Tópicos Especiais em Bioquímica (3).

Principalmente para alunos que escolhem a área de especialização em bioquímica. Discute um pequeno número de problemas atuais em bioquímica em profundidade. Requer a leitura de artigos de pesquisa publicados na área. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação produzem um trabalho de conclusão de curso com base na literatura técnica sobre um tópico escolhido em consulta com o instrutor. Pré-requisito (s): BIOL 211, CHEM 662 e 663.

BIOL 666B. Cancer Biology (3).

Os mecanismos básicos da carcinogênese são abordados discutindo o controle do crescimento celular normal e anormal em vários sistemas modelo. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação também enviam um trabalho de conclusão de curso tratando de um tópico específico a ser determinado por discussão com o instrutor. Pré-requisito (s): BIOL 420.

BIOL 669. Research In Biochemistry (2).

Listado como CHEM 669. Os alunos do campo da bioquímica participam de um projeto de pesquisa de bioquímica sob a direção de um membro do corpo docente. Requer um relatório escrito resumindo os resultados. Apenas para crédito de graduação. Repetível uma vez para crédito. Pré-requisito (s): BIOL 420 e CHEM 662 ou 663 e CHEM 664 e consentimento do instrutor.

BIOL 710. Glicobiologia (3).

Apresenta a biossíntese, estrutura e função de glicoproteínas. Abrange os vários papéis dos carboidratos na modificação da estrutura e função das proteínas. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação preparam um trabalho de conclusão de curso com base na literatura técnica sobre um tópico escolhido em consulta com o instrutor. Pré-requisito (s): BIOL 420.

BIOL 725. Análise da biodiversidade (3).

Levanta a teoria, princípios, métricas e aplicações das ciências da biodiversidade, incluindo sistemática, biogeografia e filogenia. O papel generalizado de dados filogenéticos na biologia evolutiva (por exemplo, biogeografia, coevolução, especiação, conservação) e outros campos (por exemplo, epidemiologia, antropologia, agricultura) são destacados. Diversidade de espécies, radiações de espécies, estrutura da árvore da vida, a riqueza de dados comparativos (de genes a proteínas e morfologia) e o papel da sistemática na biologia da conservação são discutidos. Queda oferecido, até mesmo anos.

BIOL 730. Cancer Biology (3).

Os mecanismos básicos da carcinogênese são abordados discutindo o controle do crescimento celular normal e anormal em vários sistemas modelo. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação também enviam um trabalho de conclusão de curso tratando de um tópico específico a ser determinado por discussão com o instrutor. Pré-requisito (s): BIOL 420.

BIOL 738. Interações entre plantas e animais (3).

Desenvolve e expande conceitos básicos ecológicos e evolutivos apresentados em cursos anteriores de biologia, incluindo seleção natural, coevolução, crescimento populacional e fatores que estruturam comunidades ecológicas. Aplica esses conceitos ao estudo da herbivoria, polinização por animais e dispersão de sementes por animais. Projetado para melhorar as habilidades dos alunos para ler criticamente a literatura científica primária atual, com ênfase particular na identificação e avaliação de evidências para hipóteses em ecologia e biologia evolutiva.Apresenta o processo de revisão por pares e aprimora as habilidades de redação científica dos alunos. Os alunos escrevem um artigo de mini-revisão de uma hipótese atual no campo da interação animal-planta. Também é necessária uma apresentação oral com base nas conclusões da mini-revisão. Pré-requisito (s): BIOL 418 ou curso de ecologia geral equivalente.

BIOL 740. Tópicos em Biologia de Graduação (2-4).

Palestra, laboratório, técnicas de campo, leituras selecionadas ou curso de discussão pertencente a um tópico biológico específico não disponível no currículo regular. Pode incluir apresentações orais e / ou trabalhos escritos. Os tópicos são desenvolvidos por membros do corpo docente individualmente e refletem tópicos atuais, análises aprofundadas e especialidades biológicas. Repetível para crédito de até 6 horas de crédito. Pré-requisito (s): quaisquer dois dos três cursos a seguir - BIOL 418, 419, 420 e consentimento do instrutor.

BIOL 740D. Computing for Biologists (3).

Quase tudo que um biólogo orgânico faz com dados pode ser muito auxiliado por algumas ferramentas básicas de bioinformática. Este curso apresentará vários deles, incluindo expressões regulares, interação com computadores por meio do shell, acesso à computação de alto desempenho, script Python básico e ambiente de análise de dados R. Pré-requisito (s): pelo menos dois dos seguintes - BIOL 418, 419, 420 ou aprovação do instrutor.

BIOL 740I. Design Experimental (3).

Uma visão geral dos componentes críticos do design experimental de som, erros comuns e diferenças filosóficas nas abordagens. Todos os alunos conduzem discussões de uma a duas aulas sobre os papéis atribuídos. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação apresentam seu próprio projeto experimental e conduzem uma discussão em classe sobre a abordagem usada, suposições e possíveis pontos fracos. Pré-requisito (s): quaisquer dois dos três cursos a seguir - BIOL 418, BIOL 419, BIOL 420 ou consentimento do instrutor.

BIOL 740M. Métodos em Modelagem de Equações Estruturais para STEM (3).

Fornece aos alunos ferramentas para realizar análises SEM em R (uma linguagem de programação estatística). SEM permite o teste de relações multivariadas de causa e efeito e permite uma compreensão holística das relações complexas comuns às ciências biológicas. Pré-requisito (s): graduação em pé.

BIOL 760. Biologia Molecular Experimental (4).

2 horas de aula 4 horas de laboratório. Apresenta a alunos de graduação e pós-graduação de nível superior as técnicas de biologia molecular. A metodologia envolve principalmente a manipulação de DNA e a expressão de material genético em sistemas procarióticos e eucarióticos. Pré-requisito (s): BIOL 419 ou 420.

BIOL 767. Mecanismos de ação hormonal (3).

O mecanismo de ação de vários hormônios é descrito e usado para ilustrar as principais vias de transdução de sinal intracelular. Inclui o hormônio liberador de gonadotropina, os hormônios glicoproteicos, o hormônio luteinizante, o hormônio folículo-estimulante, a gonadotrofina coriônica, o hormônio estimulador da tireóide, os hormônios esteróides, os hormônios tireoidianos, ativadores / inibidores, prostaglandinas, insulina e hormônio do crescimento. Principalmente palestras cobrindo as vias de transdução de sinal. Os alunos escrevem breves resumos de artigos de pesquisa recentes relacionados aos tópicos de aula da semana atual. Cada aluno faz uma apresentação oral de um artigo de pesquisa em formato de clube de jornal. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação escrevem um trabalho de conclusão de curso descrevendo em detalhes um hormônio não descrito em classe e seu mecanismo de ação. Pré-requisito (s): BIOL 420 e CHEM 662 ou seus equivalentes, mais BIOL 526 ou 534 ou seus equivalentes e consentimento do instrutor.

BIOL 773. Statistical Applications in Biology (3).

Apresenta projetos experimentais e análises estatísticas que são comumente usados ​​em pesquisas biológicas. Concentra-se em análises estatísticas univariadas, incluindo testes t, análise de variância, equivalentes não paramétricos de ANOVA, regressão linear, testes de qualidade de ajuste e análise de dados categóricos. Aplicações para questões de pesquisa que surgem na pesquisa biológica, incluindo a própria pesquisa dos alunos, são enfatizadas. Os alunos também recebem treinamento no uso de software de análise estatística. Recomenda-se a inscrição anterior no STAT 370.

BIOL 780. Molecular Genetics (3).

Estuda a natureza físico-química do material genético e os mecanismos de regulação genética do metabolismo. Os alunos que ganham crédito de pós-graduação produzem um trabalho final e apresentam um seminário de classe com base na literatura técnica sobre um tópico escolhido em consulta com o instrutor. Pré-requisito (s): BIOL 419.

BIOL 781. Educação Cooperativa (1-4).

Os alunos que buscam o grau de MS sem tese podem ganhar experiência profissional prática, sob supervisão acadêmica, que complementa o programa acadêmico do aluno. BIOL 781N é para estágios que duram no máximo um semestre ou verão e não podem ser remunerados. A experiência do estagiário a ser usada para crédito deve ser aprovada pelo comitê do projeto final de pós-graduação do aluno. Um produto acadêmico da experiência, como um resumo escrito e / ou apresentação oral, é designado pelo comitê de conclusão de graduação. Pré-requisito (s): aceitação no programa MS.

BIOL 781N. Estágio em Biologia (1-4).

Os alunos que buscam o grau de MS sem tese podem ganhar experiência profissional prática, sob supervisão acadêmica, que complementa o programa acadêmico do aluno. BIOL 781N é para estágios que duram no máximo um semestre ou verão e não podem ser remunerados. A experiência do estagiário a ser usada para crédito deve ser aprovada pelo comitê do projeto final de pós-graduação do aluno. Um produto acadêmico da experiência, como um resumo escrito e / ou apresentação oral, é designado pelo comitê de conclusão de graduação. Pré-requisito (s): aceitação no programa MS.

BIOL 797. Seminário Departamental (1).

Fórum de apresentação e discussão semanal de projetos de pesquisa realizados por cientistas convidados de departamentos e instituições externas, docentes departamentais e alunos de pós-graduação. Todos os alunos de pós-graduação vinculados ao MS são obrigados a participar do seminário a cada semestre e devem se inscrever no curso para obter crédito durante dois semestres. Os alunos inscritos no curso devem comparecer a todos os seminários apresentados no curso, preencher uma avaliação de cada seminário e fazer uma apresentação de 15 minutos em estilo encontro profissional de suas pesquisas. Repetível para crédito de até 5 horas de crédito. Pré-requisito (s): aceitação no programa MS.


O que você vai estudar

Ano 1

Todos os alunos de ciências biológicas estudam os mesmos cursos básicos no ano 1. Esses cursos fornecem uma ampla base em biologia, habilidades práticas e analíticas.

Você aprenderá técnicas básicas de laboratório e estudará assuntos de biologia moderna que abrangem a amplitude das áreas de ciências biológicas e também podem incluir química biológica.

Você também pode escolher cursos opcionais. Podem ser de outras áreas acadêmicas da Universidade.

Habilidades chave

Como parte integrante de seus estudos, você obterá habilidades essenciais que aprimoram sua empregabilidade a longo prazo.

Ano 2

Você começará a se especializar em uma área específica das ciências biológicas, escolhendo cursos que abordam temas como:

  • biologia molecular e celular
  • bioquímica
  • biotecnologia
  • genética
  • ecologia
  • evolução
  • biologia animal e vegetal

Fornecemos aos alunos todas as informações de que precisam para desenvolver seu programa de acordo com suas necessidades.

Os cursos obrigatórios e recomendados para Ecologia cobrem tópicos como:

  • origem da variação hereditária
  • fatores que controlam a abundância e distribuição de organismos globalmente
  • forças evolutivas que impulsionaram a diversificação da vida animal

Você ainda pode escolher cursos de outras áreas da Universidade como cursos opcionais.

No final do Ano 2, você progredirá para a especialização em matéria biológica escolhida, o que levará ao programa de honras de sua escolha.

Ano 3

Você se especializará em sua área preferida de ciências biológicas, escolhendo entre nossas especializações de assunto:

  • Bioquímica
  • Biotecnologia
  • Biologia Celular
  • Desenvolvimento, regeneração e células-tronco
  • Ecologia
  • Biologia evolucionária
  • Genética
  • Imunologia
  • Biologia molecular
  • Genética molecular
  • Ciência Vegetal
  • Zoologia

Seus cursos irão prepará-lo para a exploração da literatura científica, análise de dados científicos e trabalho de pesquisa. Você também receberá treinamento em habilidades de laboratório e fará cursos que se concentram no trabalho de campo.

Em Ecologia, algumas das coisas que você aprenderá são:

  • mudanças na população de espécies
  • técnicas de estudo de campo
  • diversidade animal e os processos que levaram a essa diversidade

É possível fazer uma combinação de cursos que permitirão que você troque o programa de honras no final do Ano 3.

Você pode ter a oportunidade de estudar no exterior.

Ano 4

Você se especializará em sua área preferida de ciências biológicas, escolhendo entre nossas especializações de assunto:

  • Bioquímica
  • Biotecnologia
  • Biologia Celular
  • Desenvolvimento, regeneração e células-tronco
  • Ecologia
  • Biologia evolucionária
  • Genética
  • Imunologia
  • Biologia molecular
  • Genética molecular
  • Ciência Vegetal
  • Zoologia

Seus cursos irão prepará-lo para a exploração da literatura científica, análise de dados científicos e trabalho de pesquisa. Você também receberá treinamento em habilidades de laboratório e fará cursos que se concentram no trabalho de campo.

Em Ecologia, algumas das coisas que você aprenderá são:

  • mudanças na população de espécies
  • técnicas de estudo de campo
  • diversidade animal e os processos que levaram a essa diversidade

É possível fazer uma combinação de cursos que permitirão que você troque o programa de honras no final do Ano 3.

Você pode ter a oportunidade de estudar no exterior.

Estrutura do programa

Saiba mais sobre os cursos obrigatórios e opcionais deste programa de graduação.

Para ter uma ideia do que você estudará neste programa, publicamos as informações mais recentes disponíveis. No entanto, observe que isso pode não ser para o ano de entrada, mas para um ano acadêmico diferente.


Posição de graduação: UKentucky.InsectAdaptation

Meu laboratório na Universidade de Kentucky tem uma vaga para um aluno de doutorado
para conduzir pesquisas sobre riscos ecológicos associados à genética
insetos modificados. Especificamente, este aluno estará investigando o
até que ponto a base genética, variabilidade ambiental e / ou
a seleção natural influencia a eficácia da letalidade condicional
transgenes usados ​​para controle de insetos estéreis.

Nick Teets
Professor assistente
Departamento de Entomologia
Universidade de Kentucky

Escritório: 317 Plant Science Building
Telefone: (859) -257-7459


Ecologista de riachos, King County, WA

A Divisão de Recursos Hídricos e Terrestres do Condado de King (Seattle, WA) está procurando um ecologista de riachos para um cargo de Planejador de Qualidade da Água I. Espera-se que a pessoa selecionada para esta posição forneça assistência técnica e serviços para estudos e projetos em ecossistemas de riachos e rios geralmente focados na realização de macroinvertebrados, habitats e investigações de qualidade da água em King County. A pessoa deve ter um amplo histórico ecológico e experiência em analisar e interpretar dados de qualidade da água. Conhecimento e experiência com ecologia de riachos, macroinvertebrados, habitat ribeirinho e qualidade da água são necessários, mas habilidades relevantes em pesca, pântanos e anfíbios, além de toxicologia aquática também são desejáveis. O candidato também fornecerá suporte técnico para uma variedade de projetos de qualidade da água, que vão desde a qualidade da água da chuva até impactos de contaminantes. Os candidatos devem ter habilidades estatísticas e de análise de dados, além de experiência no uso de bancos de dados e SIG para análise espacial e desenvolvimento de mapas. O Condado de King e a Divisão de Recursos Hídricos e Terrestres valorizam perspectivas e experiências de vida diversas e incentivam pessoas de todas as origens a se candidatarem, incluindo pessoas de cor, imigrantes, refugiados, mulheres, LGBTQ, pessoas com deficiência e veteranos.


Assista o vídeo: Livros que indico para quem quer ter o DOMÍNIO nas ANÁLISES e INTERPRETAÇÕES de dados GENÉTICOS (Fevereiro 2023).